输尿管镜碎石术是输尿管结石腔内碎石的主要治疗方法。输尿管镜是一面直径约3-4毫米的非常细的镜子。通过尿道进入膀胱，进入输尿管遇到结石后，可以通过气压弹道、激光等碎石设备快速粉碎结石。正常情况下，碎石后的直径小于3毫米，有利于结石的排出，排出时不会有疼痛。

在输尿管镜出现之前，输尿管结石主要是通过体外冲击波碎石或开放手术取石。开放手术腹部切口大，术后疼痛，恢复缓慢。

输尿管镜手术是通过细镜，通过尿道逆行到膀胱，然后从输尿管口上行到输尿管，找到结石位置，用激光或气压弹道粉碎结石，然后取出体外或自行排出体外。手术没有手术切口，损伤小。但是是腔道手术，因为肾脏相当于通道上的一个盲端。手术过程中会向输尿管注水，只有冲开一定的空间才能进行手术。这时会引起上尿路，即输尿管上部和肾压增加。许多结石可能会引起细菌的反向感染，如果它们伴随着细菌，压力增加，它们可能会导致细菌通过肾脏。

在输尿管镜碎石过程中会对粘膜造成一定的损伤，术后可能会出现血尿，通常血尿不需要特殊治疗，可以自行缓解。