内蒙古的甲状腺医院数量会受到多种因素的影响，包括地区经济发展水平、医疗资源分布、人口密度、政策支持以及医院的规模和特色等。

1. 地区经济发展水平：经济较发达的地区，如呼和浩特、包头等，可能会有更多资金投入医疗建设，从而吸引更多的甲状腺专科医院或在综合医院中设立更完善的甲状腺专科。

2. 医疗资源分布：一些医疗资源集中的城市，会更容易形成专业的甲状腺诊疗机构。

3. 人口密度：人口密集的区域，对医疗服务的需求较大，可能促使更多甲状腺医院的设立。

4. 政策支持：当地政府对医疗卫生事业的支持力度，会影响甲状腺医院的建设和发展。

5. 医院的规模和特色：部分规模较大、具有特色诊疗技术的医院，在甲状腺疾病诊治方面可能更具优势。

综合以上因素，要准确统计内蒙古的甲状腺医院数量具有一定难度，但可以通过相关医疗部门的统计数据、网络搜索或咨询当地的医疗行业从业者来获取较为准确的信息。