牡丹江有多家医院可以治疗甲状腺疾病，包括牡丹江医学院附属红旗医院、牡丹江市第一人民医院、牡丹江市第二人民医院、牡丹江市中医医院、牡丹江心血管病医院等。

1. 牡丹江医学院附属红旗医院：这是一所集医疗、教学、科研、预防保健于一体的综合医院，其内分泌科拥有专业的医疗团队和先进的诊疗设备，能为甲状腺疾病患者提供精准的诊断和有效的治疗方案。

2. 牡丹江市第一人民医院：作为地区的重要医疗机构，在甲状腺疾病的治疗方面积累了丰富的经验。医院的甲状腺诊疗团队能够熟练运用各种治疗手段，如药物治疗、手术治疗和放射性碘治疗等。

3. 牡丹江市第二人民医院：其甲状腺专科具备完善的检查和治疗体系，为患者提供个性化的治疗服务，包括针对不同类型甲状腺疾病的药物选择和治疗方案的制定。

4. 牡丹江市中医医院：发挥中医特色，采用中西医结合的方法治疗甲状腺疾病。通过中药调理、针灸等中医疗法，配合现代医学的治疗手段，提高治疗效果，减少副作用。

5. 牡丹江心血管病医院：虽然以心血管疾病治疗为主，但对于甲状腺疾病引起的心血管并发症也具有专业的诊疗能力。

总之，患者可以根据自身的病情和需求，选择适合自己的医院进行就诊。在治疗过程中，要积极配合医生的治疗方案，定期复查，以达到良好的治疗效果。