半夜感觉直肠里疼痛并有排便欲望可能是功能性腹痛、肠易激综合征、慢性结肠炎等原因导致的，建议及时就诊以确定具体病因。

功能性腹痛是指在没有明确器质性病变的情况下出现的腹部不适，通常不需要特殊治疗，可通过生活方式改善来缓解症状；肠易激综合征是一种常见的肠道功能紊乱疾病，主要表现为腹痛、腹泻等症状，可遵医嘱使用阿莫西林克拉维酸钾片进行抗感染治疗；慢性结肠炎是结肠黏膜长期存在炎症反应的一种疾病，典型症状包括腹痛、腹泻、便秘等，严重时会导致直肠下垂，引起疼痛感，需要及时就医，并配合医生通过药物治疗的方式控制病情发展，常用药物主要有柳氮磺吡啶肠溶片、美沙拉嗪肠溶片等。

如果患者还伴有发热、恶心呕吐等情况，则可能与急性胃肠炎有关。此时要警惕脱水风险，需及时补液电解质。

针对上述提及的所有可能原因，都强调了及时就医的重要性。同时，在诊断前应避免食用可能导致肠胃不适的食物或饮料，以免加重症状。