阴茎根部疼痛尿血可能是前列腺炎所引发的，还有可能是泌尿系统感染所导致的，另外和肾结石以及肾炎有很大的关系。

如果有阴茎根部疼痛以及尿血的情况，需要进行实验室和影像学检查，明确引起疼痛和尿血的原因，可采取适合的药物治疗，如果结石较大，也可选择手术的方法治疗。