南京有多家医院在男科治疗方面具有较高的声誉和专业水平，包括南京鼓楼医院、南京同仁医院、南京市第一医院、南京医科大学第一附属医院和东南大学附属中大医院等。这些医院均设有专业的男科科室，拥有先进的诊疗设备和专业的医生团队。

1. 南京鼓楼医院：作为江苏省内知名的三甲医院，南京鼓楼医院的男科科室是全国西医三甲医院中最早有独立建制的男科之一，现已成为集男科医疗、教学、科研为一体的专业、正规的男科疾病医学中心。

2. 南京同仁医院：南京同仁医院是一家集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合性医院，男科科室拥有先进的诊疗设备和专业的医生团队，专注于泌尿外科疾病的研究与诊治，设备先进、技术精湛。

3. 南京市第一医院：南京市第一医院是南京市卫生局直属的三级甲等综合性医院，男科科室技术力量雄厚，诊疗效果显著，能够开展多种男科疾病的诊断和治疗。

4. 南京医科大学第一附属医院：南京医科大学第一附属医院泌尿外科是国家临床重点专科建设单位，卫生部首批人类精子库技术准入单位学科，是国内一流的现代化学科，男科治疗水平较高。

5. 东南大学附属中大医院：东南大学附属中大医院泌尿外科是江苏省临床重点专科建设单位，拥有国际先进的医疗设备和技术，开展多项先进的男科手术和治疗。

以上医院在男科治疗方面均具有较高的专业水平和丰富的临床经验，患者可以根据自己的实际情况和具体需求选择合适的医院进行就诊。在选择医院时，建议考虑医院的专业水平、服务质量、医生经验以及设备条件等因素