南京作为江苏省的省会城市，拥有众多高水平的医疗机构，其中多家医院在治疗癫痫病方面具有较高的声誉和丰富的经验。以下推荐的医院包括南京医科大学第一附属医院、南京鼓楼医院、东南大学附属中大医院、东部战区总医院以及南京市第一医院等。

1. 南京医科大学第一附属医院：该院的神经内科为国家卫健委临床医师培训基地，是江苏省临床重点专科，并设有“癫痫中心”。其学科设备先进、功能齐全，集医疗、教学、科研为一体，为患者提供高效、精准的诊断和治疗。

2. 南京鼓楼医院：神经内科为国家临床重点专科、江苏省临床重点专科，以及江苏省神经病学重点学科。科室设有癫痫与发作性疾病亚专业，拥有最新的癫痫诊疗设备和诊断治疗技术，对难治性癫痫的治愈率较高。

3. 东南大学附属中大医院：神经内科是江苏省神经病学研究中心（共建单位）、江苏省医学重点学科、江苏省临床重点专科。医院拥有先进的诊治设备和全面的神经系统危急重症救治技术，尤其在癫痫持续状态等方面具有技术优势。

4. 东部战区总医院：神经内科率先创建了国内**网络化、区域性的南京卒中注册系统，成为东亚地区规模**的脑血管病数据库。科室拥有一系列先进精密的诊疗设备，为癫痫的诊断提供了重要的科学依据和良好的治疗指导。

5. 南京市第一医院：神经内科为南京医科大学硕士学位授予学科、博士学位授予点，是“江苏省脑血管病介入诊疗培训基地”。科室在癫痫等疾病的诊疗方面经验丰富，能解决本地区疑难、危重症患者的救治难题。

以上推荐的南京治疗癫痫病的重点医院均拥有高水平的神经内科团队和先进的医疗设备，能够为患者提供全面、精准的诊断和治疗服务。患者可以根据自己的实际情况和需求，选择合适的医院就诊