在抚州，选择治疗甲状腺疾病效果好的医院，需要考虑医院的综合实力、专家团队、医疗设备、患者口碑以及医疗服务等因素。

1. 综合实力：包括医院的规模、科室设置、科研水平等。规模较大的综合性医院通常在医疗资源整合和疑难病症诊治方面具有优势。例如抚州市第一人民医院，其作为地区的大型综合医疗机构，在甲状腺疾病的诊疗上拥有丰富的经验和较高的技术水平。

2. 专家团队：优秀的专家团队是治疗效果的关键。医生的专业素养、临床经验和学术背景都影响着治疗方案的制定和实施。像抚州市中医院的内分泌科，拥有一批在甲状腺领域深耕多年的专家，能够为患者提供精准的诊断和个性化的治疗方案。

3. 医疗设备：先进的医疗设备有助于更准确地诊断和治疗甲状腺疾病。如高精度的超声设备、放射性核素检测仪等。抚州第五医院在这方面投入较大，为甲状腺疾病的诊治提供了有力的硬件支持。

4. 患者口碑：患者的评价能反映医院的实际治疗效果和服务质量。可以通过网络平台、患者交流群等了解其他患者的就医体验。

5. 医疗服务：包括就诊流程的便捷性、医护人员的服务态度等。良好的医疗服务能提高患者的就医舒适度和依从性，对治疗效果也有积极影响。

综合考虑以上因素，患者可以根据自身的病情和需求，选择适合自己的医院进行甲状腺疾病的治疗。同时，在治疗过程中要积极配合医生，遵循医嘱，以提高治疗效果。