在南京，有多家医院在甲状腺疾病的治疗方面表现出色，如医疗技术水平、专家团队、医疗设备、患者口碑、医院的综合实力等。

1.医疗技术水平：先进的诊疗技术是治疗甲状腺疾病的关键。例如，一些医院采用了精准的微创手术方式，能够减少创伤和并发症，提高治疗效果。像南京鼓楼医院，其在甲状腺外科领域拥有丰富的经验和精湛的技术。

2.专家团队：专业且经验丰富的医生团队对于准确诊断和制定个性化治疗方案至关重要。江苏省人民医院的甲状腺专家团队在业内具有较高的声誉。

3.医疗设备：先进的医疗设备如高精度的超声仪器、放射性核素检测仪等，能为准确诊断和治疗提供有力支持。南京市第一医院在设备投入方面较为突出。

4.患者口碑：患者的评价和反馈是衡量医院治疗效果的重要参考。南京医科大学附属第二医院在患者中拥有良好的口碑。

5.医院的综合实力：包括医院的规模、科室设置、科研能力等。东南大学附属中大医院综合实力较强，为甲状腺疾病的治疗提供了全面保障。

总之，选择治疗甲状腺疾病的医院需要综合考虑多方面因素。患者可以根据自身的病情和需求，选择最适合自己的医院进行治疗。